Protokoly používané v QSAR

QSAR je skratka pre kvantitatívny vzťah medzi štruktúrou a aktivitou. Používa sa ukázať, ako môže byť kvantitatívne chemická štruktúra súvisí s konkrétnym procesu, je QSAR často používa pre navrhovanie lieky a drogy. Táto metóda sa používa pre vedenie chemickej syntézy, pretože existuje mnoho tisíce rôznych možných štruktúr pre jednu molekulu a vedci by inak odpad veľa času testovaním každý štruktúru. Štatistiky hrajú dôležitú úlohu v metodike QSAR. Viacnásobná lineárna regresia

Viacnásobná lineárna regresia sa používa, keď existuje niekoľko štúdií, ktoré používajú sú spojené na jeden konkrétny chemickej štruktúry. Rovnica je vyvinutý, že, napríklad, môže ukázať vzťah medzi znížením veľkosti nádoru a prítomnosť hydrofóbne skupiny na štvrtej pozícii fenylovom kruhu. Táto analýza znižuje veľa rôznych látok, takže vzťah možno interpretovať iba pomocou niekoľkých parametrov, ktoré sú najdôležitejšie.
Rozpoznávanie

Rozpoznávanie slúži na definovanie parametrov , ktoré sú výsledkom sú špecifické chemické štruktúry zoskupené. Existuje niekoľko rôznych typov analýz rozpoznávanie, medzi ktoré patrí analýza hlavných komponentov, počítačového automatizovaného hodnotenia štruktúry a automatizovanú analýzu dát pomocou metód rozpoznávania. Štatistika rozpoznávania vzorov používať pôvodné dáta a bude korelovať rôzne štruktúry s biologickými výsledkov založených na rôznych rozmerov, s najvýznamnejšou bytosti v prvom vypočítanej zložky.
Porovnávacia analýza molekulárnej poľa

Táto verzia QSAR sa čiastkové analýzy najmenších štvorcov spárovaný s krížovou validáciou vytvoriť predpoveď pre biologickú aktivitu. V tomto type metodiky, vedec bude priradiť konkrétne pravidlá pre kompenzáciu molekulárnej štruktúry. Každý z molekúl je vhodný do siete a potom sa rôzne interakcie sa vypočíta na základe interakcií z sondy atómom do rôznych sietí. Existuje mnoho rôznych rovnice, ktoré môžu mať za následok. Na rozdiel od iných typov regresie, tým vznikne rovnica, v ktorých sú oveľa viac parametrov ako možných zlúčenín
Apex -. 3D

Apex-3D využíva systém, ktorý automaticky zvolí najlepšie vyrovnanie a prispôsobenie pre štruktúry na základe potrebnej biologickej odpovede z predchádzajúcich experimentov. Je možné odhaliť vplyv rozdielne orientáciu väzby, antagonistický účinok v porovnaní s agonistickým účinkom a účinkom rôznych typov receptorov. To vytvára 2D a 3D topografické matice a môžu byť zdrojom informácií pre dvojice molekúl, skôr než jednotlivé molekuly.
Genetické Funkcia Aproximácia

Genetické funkcie priblíženia sa používa, keď je málo vzorky a veľa rôznych premenných, ktoré sú predmetom vyšetrovania, a keď dátovej sady nemajú lineárne vzťahy. Používa najlepšie hodnotené modely a najhoršie hodnotené modely vypočítané z nespracovaných dát. Stavia lepšie a kvalitnejšie modely nahradia najhoršie hodnotené modely. Mnoho rôznych viac spoje sú potom poskytované vedcov, ktorí potom vyberie finálny model. Podobnosť medzi týmito modelmi sú študované poskytnúť informácie o štrukturálnych a biologických súvislostí.